Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C10orf55Q5SWW7 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms