Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms