Protein–RNA interactions for Protein: Q33E94

RFX4, Transcription factor RFX4, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX4Q33E94 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFX4Q33E94 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms