Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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CCDC96Q2M329 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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CCDC96Q2M329 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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CCDC96Q2M329 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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CCDC96Q2M329 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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CCDC96Q2M329 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC96Q2M329 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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