Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Q1T7F1 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Q1T7F1 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Q1T7F1 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Q1T7F1 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Q1T7F1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Q1T7F1 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Q1T7F1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Q1T7F1 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Q1T7F1 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Q1T7F1 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Q1T7F1 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Q1T7F1 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Q1T7F1 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Q1T7F1 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Q1T7F1 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Q1T7F1 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Q1T7F1 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Q1T7F1 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Q1T7F1 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Q1T7F1 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Q1T7F1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Q1T7F1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Q1T7F1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Q1T7F1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Q1T7F1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Q1T7F1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Q1T7F1 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Q1T7F1 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Q1T7F1 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Q1T7F1 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Q1T7F1 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Q1T7F1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Q1T7F1 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Q1T7F1 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Q1T7F1 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Q1T7F1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Q1T7F1 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Q1T7F1 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Q1T7F1 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Q1T7F1 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Q1T7F1 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Q1T7F1 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Q1T7F1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Q1T7F1 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Q1T7F1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Q1T7F1 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Q1T7F1 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Q1T7F1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Q1T7F1 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Q1T7F1 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
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