Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP6Q16828 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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