Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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