Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SYPL1Q16563 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SYPL1Q16563 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SYPL1Q16563 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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