Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TAF1AQ15573 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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