Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NCF4Q15080 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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