Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NCAPHQ15003 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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