Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms