Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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