Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms