Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAD4Q13485 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
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