Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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CALCOCO2Q13137 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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CALCOCO2Q13137 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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