Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
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