Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LMAN2Q12907 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMAN2Q12907 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMAN2Q12907 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMAN2Q12907 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMAN2Q12907 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMAN2Q12907 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMAN2Q12907 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMAN2Q12907 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMAN2Q12907 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMAN2Q12907 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMAN2Q12907 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
LMAN2Q12907 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMAN2Q12907 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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