Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STX4Q12846 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STX4Q12846 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
STX4Q12846 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STX4Q12846 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
STX4Q12846 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STX4Q12846 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STX4Q12846 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
STX4Q12846 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
STX4Q12846 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
STX4Q12846 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STX4Q12846 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STX4Q12846 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
STX4Q12846 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
STX4Q12846 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
STX4Q12846 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
STX4Q12846 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
STX4Q12846 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
STX4Q12846 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
STX4Q12846 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
STX4Q12846 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
STX4Q12846 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
STX4Q12846 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
STX4Q12846 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
STX4Q12846 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
STX4Q12846 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
STX4Q12846 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
STX4Q12846 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
STX4Q12846 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
STX4Q12846 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
STX4Q12846 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
STX4Q12846 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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STX4Q12846 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
STX4Q12846 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
STX4Q12846 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
STX4Q12846 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
STX4Q12846 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
STX4Q12846 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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STX4Q12846 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
STX4Q12846 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
STX4Q12846 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
STX4Q12846 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
STX4Q12846 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
STX4Q12846 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
STX4Q12846 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
STX4Q12846 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
STX4Q12846 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
STX4Q12846 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
STX4Q12846 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
STX4Q12846 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
STX4Q12846 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
STX4Q12846 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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STX4Q12846 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
STX4Q12846 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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STX4Q12846 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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STX4Q12846 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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STX4Q12846 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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STX4Q12846 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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STX4Q12846 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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STX4Q12846 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
STX4Q12846 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
STX4Q12846 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
STX4Q12846 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
STX4Q12846 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
STX4Q12846 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
STX4Q12846 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
STX4Q12846 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
STX4Q12846 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
STX4Q12846 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
STX4Q12846 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
STX4Q12846 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
STX4Q12846 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
STX4Q12846 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
STX4Q12846 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
STX4Q12846 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
STX4Q12846 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
STX4Q12846 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
STX4Q12846 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
STX4Q12846 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
STX4Q12846 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
STX4Q12846 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
STX4Q12846 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
STX4Q12846 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms