Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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