Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCN1BQ07699 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms