Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms