Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms