Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms