Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYBPC1Q00872 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms