Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFM1P61960 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFM1P61960 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFM1P61960 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFM1P61960 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFM1P61960 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFM1P61960 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFM1P61960 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFM1P61960 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFM1P61960 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFM1P61960 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFM1P61960 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFM1P61960 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFM1P61960 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFM1P61960 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFM1P61960 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFM1P61960 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFM1P61960 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFM1P61960 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UFM1P61960 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UFM1P61960 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UFM1P61960 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
UFM1P61960 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UFM1P61960 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UFM1P61960 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UFM1P61960 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UFM1P61960 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UFM1P61960 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UFM1P61960 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UFM1P61960 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UFM1P61960 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UFM1P61960 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UFM1P61960 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UFM1P61960 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UFM1P61960 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UFM1P61960 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UFM1P61960 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
UFM1P61960 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UFM1P61960 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
UFM1P61960 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UFM1P61960 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UFM1P61960 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UFM1P61960 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UFM1P61960 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UFM1P61960 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UFM1P61960 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UFM1P61960 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UFM1P61960 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UFM1P61960 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UFM1P61960 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms