Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms