Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCCD1P59942 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms