Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00313P59037 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms