Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH15P55291 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH15P55291 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH15P55291 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH15P55291 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH15P55291 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH15P55291 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH15P55291 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH15P55291 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH15P55291 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH15P55291 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH15P55291 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH15P55291 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH15P55291 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH15P55291 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH15P55291 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH15P55291 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH15P55291 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH15P55291 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH15P55291 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH15P55291 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH15P55291 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH15P55291 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH15P55291 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH15P55291 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH15P55291 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH15P55291 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH15P55291 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH15P55291 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH15P55291 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH15P55291 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH15P55291 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH15P55291 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH15P55291 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH15P55291 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH15P55291 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH15P55291 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH15P55291 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH15P55291 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH15P55291 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH15P55291 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH15P55291 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH15P55291 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH15P55291 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH15P55291 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH15P55291 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH15P55291 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH15P55291 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH15P55291 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH15P55291 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH15P55291 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH15P55291 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH15P55291 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH15P55291 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH15P55291 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH15P55291 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH15P55291 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH15P55291 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH15P55291 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH15P55291 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH15P55291 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH15P55291 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH15P55291 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH15P55291 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH15P55291 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH15P55291 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH15P55291 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH15P55291 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH15P55291 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH15P55291 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH15P55291 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH15P55291 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH15P55291 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH15P55291 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH15P55291 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH15P55291 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH15P55291 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH15P55291 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH15P55291 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH15P55291 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH15P55291 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH15P55291 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH15P55291 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH15P55291 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH15P55291 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH15P55291 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH15P55291 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH15P55291 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH15P55291 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH15P55291 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH15P55291 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH15P55291 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH15P55291 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH15P55291 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH15P55291 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH15P55291 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH15P55291 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH15P55291 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH15P55291 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH15P55291 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms