Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLTPP55058 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLTPP55058 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLTPP55058 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLTPP55058 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLTPP55058 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLTPP55058 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLTPP55058 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLTPP55058 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLTPP55058 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PLTPP55058 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLTPP55058 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLTPP55058 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLTPP55058 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLTPP55058 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLTPP55058 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLTPP55058 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLTPP55058 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLTPP55058 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLTPP55058 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLTPP55058 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLTPP55058 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLTPP55058 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLTPP55058 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLTPP55058 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLTPP55058 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLTPP55058 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLTPP55058 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLTPP55058 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLTPP55058 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLTPP55058 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLTPP55058 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLTPP55058 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLTPP55058 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLTPP55058 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLTPP55058 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLTPP55058 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLTPP55058 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLTPP55058 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLTPP55058 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLTPP55058 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLTPP55058 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLTPP55058 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLTPP55058 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLTPP55058 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLTPP55058 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLTPP55058 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PLTPP55058 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLTPP55058 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLTPP55058 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLTPP55058 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLTPP55058 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLTPP55058 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLTPP55058 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLTPP55058 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLTPP55058 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLTPP55058 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLTPP55058 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLTPP55058 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLTPP55058 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLTPP55058 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLTPP55058 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLTPP55058 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLTPP55058 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLTPP55058 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLTPP55058 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLTPP55058 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLTPP55058 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLTPP55058 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLTPP55058 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLTPP55058 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLTPP55058 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLTPP55058 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLTPP55058 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PLTPP55058 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLTPP55058 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLTPP55058 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLTPP55058 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLTPP55058 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLTPP55058 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLTPP55058 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLTPP55058 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLTPP55058 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLTPP55058 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLTPP55058 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLTPP55058 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLTPP55058 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLTPP55058 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLTPP55058 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLTPP55058 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLTPP55058 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLTPP55058 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PLTPP55058 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLTPP55058 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLTPP55058 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLTPP55058 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLTPP55058 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PLTPP55058 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PLTPP55058 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLTPP55058 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms