Protein–RNA interactions for Protein: P53675

CLTCL1, Clathrin heavy chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1P53675 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCL1P53675 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCL1P53675 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCL1P53675 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCL1P53675 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCL1P53675 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCL1P53675 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCL1P53675 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCL1P53675 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCL1P53675 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCL1P53675 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCL1P53675 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCL1P53675 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCL1P53675 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCL1P53675 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCL1P53675 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCL1P53675 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCL1P53675 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCL1P53675 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCL1P53675 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCL1P53675 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCL1P53675 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCL1P53675 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCL1P53675 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCL1P53675 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCL1P53675 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLTCL1P53675 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLTCL1P53675 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLTCL1P53675 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLTCL1P53675 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLTCL1P53675 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCL1P53675 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms