Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCR4P51679 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCR4P51679 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCR4P51679 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCR4P51679 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCR4P51679 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCR4P51679 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCR4P51679 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCR4P51679 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCR4P51679 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCR4P51679 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCR4P51679 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCR4P51679 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCR4P51679 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCR4P51679 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCR4P51679 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCR4P51679 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCR4P51679 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCR4P51679 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCR4P51679 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCR4P51679 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCR4P51679 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCR4P51679 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCR4P51679 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCR4P51679 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCR4P51679 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCR4P51679 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCR4P51679 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCR4P51679 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCR4P51679 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCR4P51679 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCR4P51679 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCR4P51679 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCR4P51679 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCR4P51679 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCR4P51679 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCR4P51679 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCR4P51679 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCR4P51679 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCR4P51679 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCR4P51679 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCR4P51679 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCR4P51679 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCR4P51679 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCR4P51679 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCR4P51679 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCR4P51679 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCR4P51679 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCR4P51679 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCR4P51679 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCR4P51679 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCR4P51679 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCR4P51679 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCR4P51679 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCR4P51679 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCR4P51679 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCR4P51679 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCR4P51679 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCR4P51679 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCR4P51679 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCR4P51679 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCR4P51679 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCR4P51679 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCR4P51679 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCR4P51679 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCR4P51679 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCR4P51679 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCR4P51679 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCR4P51679 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCR4P51679 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCR4P51679 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCR4P51679 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCR4P51679 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCR4P51679 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCR4P51679 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCR4P51679 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCR4P51679 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCR4P51679 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCR4P51679 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCR4P51679 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCR4P51679 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCR4P51679 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCR4P51679 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCR4P51679 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCR4P51679 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCR4P51679 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCR4P51679 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCR4P51679 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCR4P51679 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCR4P51679 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCR4P51679 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCR4P51679 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCR4P51679 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCR4P51679 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCR4P51679 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCR4P51679 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCR4P51679 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCR4P51679 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCR4P51679 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCR4P51679 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms