Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV1P50549 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV1P50549 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV1P50549 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV1P50549 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETV1P50549 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETV1P50549 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETV1P50549 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ETV1P50549 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETV1P50549 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETV1P50549 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETV1P50549 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ETV1P50549 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETV1P50549 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETV1P50549 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETV1P50549 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETV1P50549 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETV1P50549 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETV1P50549 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETV1P50549 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETV1P50549 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETV1P50549 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETV1P50549 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETV1P50549 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETV1P50549 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETV1P50549 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ETV1P50549 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETV1P50549 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETV1P50549 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETV1P50549 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETV1P50549 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETV1P50549 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETV1P50549 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETV1P50549 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETV1P50549 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETV1P50549 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETV1P50549 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETV1P50549 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETV1P50549 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETV1P50549 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETV1P50549 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETV1P50549 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETV1P50549 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETV1P50549 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ETV1P50549 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETV1P50549 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETV1P50549 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETV1P50549 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETV1P50549 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETV1P50549 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETV1P50549 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV1P50549 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV1P50549 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV1P50549 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV1P50549 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV1P50549 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV1P50549 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV1P50549 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV1P50549 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV1P50549 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV1P50549 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV1P50549 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV1P50549 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV1P50549 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV1P50549 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV1P50549 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV1P50549 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV1P50549 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV1P50549 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV1P50549 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV1P50549 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV1P50549 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV1P50549 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV1P50549 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV1P50549 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV1P50549 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV1P50549 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV1P50549 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV1P50549 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV1P50549 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV1P50549 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV1P50549 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV1P50549 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV1P50549 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV1P50549 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV1P50549 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV1P50549 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ETV1P50549 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV1P50549 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV1P50549 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV1P50549 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV1P50549 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV1P50549 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV1P50549 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV1P50549 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV1P50549 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV1P50549 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV1P50549 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV1P50549 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETV1P50549 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms