Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms