Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPFP49454 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPFP49454 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPFP49454 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPFP49454 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPFP49454 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPFP49454 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPFP49454 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPFP49454 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPFP49454 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPFP49454 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CENPFP49454 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CENPFP49454 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CENPFP49454 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CENPFP49454 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CENPFP49454 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CENPFP49454 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CENPFP49454 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CENPFP49454 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CENPFP49454 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CENPFP49454 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPFP49454 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPFP49454 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPFP49454 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPFP49454 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPFP49454 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPFP49454 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPFP49454 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPFP49454 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPFP49454 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPFP49454 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPFP49454 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPFP49454 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPFP49454 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPFP49454 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPFP49454 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPFP49454 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPFP49454 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPFP49454 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPFP49454 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPFP49454 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPFP49454 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPFP49454 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPFP49454 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPFP49454 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPFP49454 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPFP49454 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPFP49454 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPFP49454 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPFP49454 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPFP49454 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPFP49454 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPFP49454 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPFP49454 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPFP49454 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPFP49454 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPFP49454 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPFP49454 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPFP49454 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPFP49454 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPFP49454 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPFP49454 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPFP49454 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPFP49454 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPFP49454 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPFP49454 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPFP49454 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPFP49454 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPFP49454 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPFP49454 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPFP49454 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPFP49454 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPFP49454 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPFP49454 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPFP49454 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPFP49454 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPFP49454 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPFP49454 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPFP49454 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPFP49454 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPFP49454 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPFP49454 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPFP49454 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPFP49454 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPFP49454 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPFP49454 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPFP49454 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPFP49454 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPFP49454 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPFP49454 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPFP49454 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPFP49454 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPFP49454 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPFP49454 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPFP49454 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPFP49454 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPFP49454 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPFP49454 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPFP49454 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPFP49454 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms