Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM4P49221 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM4P49221 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM4P49221 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM4P49221 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM4P49221 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM4P49221 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM4P49221 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM4P49221 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM4P49221 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM4P49221 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM4P49221 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM4P49221 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM4P49221 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM4P49221 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM4P49221 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM4P49221 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM4P49221 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM4P49221 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM4P49221 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM4P49221 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM4P49221 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM4P49221 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM4P49221 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM4P49221 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM4P49221 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM4P49221 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM4P49221 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM4P49221 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM4P49221 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM4P49221 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM4P49221 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM4P49221 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM4P49221 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM4P49221 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM4P49221 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM4P49221 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM4P49221 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM4P49221 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM4P49221 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM4P49221 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM4P49221 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM4P49221 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM4P49221 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM4P49221 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM4P49221 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM4P49221 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM4P49221 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM4P49221 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM4P49221 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM4P49221 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM4P49221 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM4P49221 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM4P49221 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM4P49221 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM4P49221 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM4P49221 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM4P49221 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM4P49221 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM4P49221 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM4P49221 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM4P49221 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM4P49221 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM4P49221 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM4P49221 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM4P49221 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM4P49221 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM4P49221 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM4P49221 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM4P49221 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM4P49221 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM4P49221 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM4P49221 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM4P49221 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM4P49221 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM4P49221 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM4P49221 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM4P49221 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM4P49221 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM4P49221 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM4P49221 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM4P49221 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM4P49221 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM4P49221 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM4P49221 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM4P49221 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM4P49221 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM4P49221 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM4P49221 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM4P49221 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM4P49221 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM4P49221 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM4P49221 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM4P49221 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM4P49221 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM4P49221 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM4P49221 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM4P49221 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM4P49221 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM4P49221 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms