Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCLMP48507 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCLMP48507 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCLMP48507 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCLMP48507 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCLMP48507 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCLMP48507 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCLMP48507 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCLMP48507 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCLMP48507 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCLMP48507 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCLMP48507 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCLMP48507 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCLMP48507 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCLMP48507 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCLMP48507 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCLMP48507 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCLMP48507 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCLMP48507 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCLMP48507 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCLMP48507 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCLMP48507 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCLMP48507 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCLMP48507 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCLMP48507 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCLMP48507 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCLMP48507 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCLMP48507 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCLMP48507 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCLMP48507 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCLMP48507 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GCLMP48507 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCLMP48507 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCLMP48507 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCLMP48507 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCLMP48507 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCLMP48507 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCLMP48507 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCLMP48507 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCLMP48507 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCLMP48507 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCLMP48507 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCLMP48507 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCLMP48507 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GCLMP48507 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCLMP48507 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GCLMP48507 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCLMP48507 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCLMP48507 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCLMP48507 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCLMP48507 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCLMP48507 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCLMP48507 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCLMP48507 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCLMP48507 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCLMP48507 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCLMP48507 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCLMP48507 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCLMP48507 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GCLMP48507 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GCLMP48507 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCLMP48507 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GCLMP48507 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCLMP48507 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCLMP48507 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCLMP48507 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCLMP48507 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCLMP48507 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCLMP48507 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCLMP48507 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCLMP48507 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCLMP48507 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCLMP48507 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCLMP48507 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCLMP48507 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCLMP48507 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCLMP48507 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCLMP48507 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCLMP48507 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLMP48507 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLMP48507 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLMP48507 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLMP48507 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLMP48507 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLMP48507 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLMP48507 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLMP48507 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLMP48507 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLMP48507 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLMP48507 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLMP48507 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLMP48507 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLMP48507 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLMP48507 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLMP48507 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLMP48507 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLMP48507 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLMP48507 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLMP48507 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLMP48507 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms