Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRATP43155 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRATP43155 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRATP43155 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRATP43155 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRATP43155 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRATP43155 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRATP43155 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRATP43155 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRATP43155 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRATP43155 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CRATP43155 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CRATP43155 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CRATP43155 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CRATP43155 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CRATP43155 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CRATP43155 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CRATP43155 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CRATP43155 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CRATP43155 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CRATP43155 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRATP43155 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRATP43155 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRATP43155 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRATP43155 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRATP43155 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRATP43155 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRATP43155 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRATP43155 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRATP43155 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRATP43155 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRATP43155 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRATP43155 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRATP43155 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRATP43155 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRATP43155 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRATP43155 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRATP43155 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRATP43155 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRATP43155 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRATP43155 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRATP43155 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRATP43155 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRATP43155 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CRATP43155 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRATP43155 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRATP43155 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRATP43155 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRATP43155 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRATP43155 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRATP43155 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRATP43155 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRATP43155 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRATP43155 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRATP43155 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms