Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGDSP41222 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms