Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms