Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TSPOP30536 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TSPOP30536 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TSPOP30536 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TSPOP30536 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TSPOP30536 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TSPOP30536 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TSPOP30536 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TSPOP30536 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TSPOP30536 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TSPOP30536 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TSPOP30536 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TSPOP30536 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TSPOP30536 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TSPOP30536 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TSPOP30536 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TSPOP30536 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TSPOP30536 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TSPOP30536 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TSPOP30536 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TSPOP30536 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TSPOP30536 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TSPOP30536 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TSPOP30536 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TSPOP30536 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TSPOP30536 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TSPOP30536 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TSPOP30536 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TSPOP30536 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TSPOP30536 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TSPOP30536 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TSPOP30536 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TSPOP30536 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TSPOP30536 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TSPOP30536 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TSPOP30536 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TSPOP30536 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TSPOP30536 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TSPOP30536 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TSPOP30536 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TSPOP30536 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TSPOP30536 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms