Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP1P29466 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP1P29466 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP1P29466 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP1P29466 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP1P29466 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP1P29466 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP1P29466 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP1P29466 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP1P29466 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP1P29466 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP1P29466 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP1P29466 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP1P29466 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CASP1P29466 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CASP1P29466 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CASP1P29466 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CASP1P29466 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CASP1P29466 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
CASP1P29466 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CASP1P29466 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP1P29466 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP1P29466 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP1P29466 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP1P29466 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP1P29466 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP1P29466 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP1P29466 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP1P29466 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP1P29466 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP1P29466 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP1P29466 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP1P29466 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP1P29466 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP1P29466 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP1P29466 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP1P29466 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP1P29466 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP1P29466 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP1P29466 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP1P29466 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP1P29466 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP1P29466 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP1P29466 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP1P29466 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP1P29466 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP1P29466 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP1P29466 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP1P29466 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP1P29466 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP1P29466 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP1P29466 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP1P29466 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP1P29466 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP1P29466 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP1P29466 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP1P29466 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP1P29466 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP1P29466 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP1P29466 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP1P29466 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP1P29466 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP1P29466 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP1P29466 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP1P29466 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP1P29466 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP1P29466 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP1P29466 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP1P29466 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP1P29466 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP1P29466 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP1P29466 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP1P29466 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP1P29466 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP1P29466 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP1P29466 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP1P29466 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP1P29466 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP1P29466 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP1P29466 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP1P29466 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP1P29466 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP1P29466 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP1P29466 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP1P29466 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP1P29466 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP1P29466 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP1P29466 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP1P29466 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP1P29466 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP1P29466 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP1P29466 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP1P29466 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP1P29466 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP1P29466 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP1P29466 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP1P29466 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP1P29466 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP1P29466 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP1P29466 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms