Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms