Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ME2P23368 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME2P23368 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME2P23368 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME2P23368 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME2P23368 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME2P23368 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME2P23368 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME2P23368 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME2P23368 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME2P23368 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME2P23368 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME2P23368 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME2P23368 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME2P23368 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME2P23368 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME2P23368 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME2P23368 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME2P23368 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ME2P23368 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ME2P23368 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ME2P23368 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ME2P23368 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ME2P23368 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ME2P23368 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ME2P23368 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME2P23368 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME2P23368 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME2P23368 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ME2P23368 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME2P23368 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME2P23368 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME2P23368 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME2P23368 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME2P23368 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ME2P23368 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME2P23368 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME2P23368 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME2P23368 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME2P23368 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME2P23368 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME2P23368 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME2P23368 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME2P23368 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME2P23368 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME2P23368 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME2P23368 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME2P23368 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME2P23368 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME2P23368 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME2P23368 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME2P23368 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME2P23368 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME2P23368 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME2P23368 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME2P23368 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ME2P23368 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME2P23368 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME2P23368 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME2P23368 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME2P23368 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME2P23368 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME2P23368 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME2P23368 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME2P23368 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME2P23368 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME2P23368 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME2P23368 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME2P23368 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME2P23368 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME2P23368 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME2P23368 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME2P23368 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME2P23368 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME2P23368 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME2P23368 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME2P23368 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME2P23368 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME2P23368 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME2P23368 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME2P23368 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME2P23368 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME2P23368 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME2P23368 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME2P23368 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME2P23368 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ME2P23368 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME2P23368 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME2P23368 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ME2P23368 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME2P23368 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME2P23368 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME2P23368 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME2P23368 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME2P23368 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME2P23368 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME2P23368 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ME2P23368 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ME2P23368 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ME2P23368 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms