Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TCP1P17987 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TCP1P17987 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TCP1P17987 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TCP1P17987 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TCP1P17987 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TCP1P17987 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TCP1P17987 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TCP1P17987 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TCP1P17987 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TCP1P17987 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TCP1P17987 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TCP1P17987 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TCP1P17987 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TCP1P17987 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCP1P17987 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCP1P17987 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCP1P17987 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCP1P17987 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCP1P17987 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCP1P17987 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCP1P17987 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCP1P17987 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCP1P17987 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TCP1P17987 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCP1P17987 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCP1P17987 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCP1P17987 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCP1P17987 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCP1P17987 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCP1P17987 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCP1P17987 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCP1P17987 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCP1P17987 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCP1P17987 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCP1P17987 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCP1P17987 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCP1P17987 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCP1P17987 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCP1P17987 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCP1P17987 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCP1P17987 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCP1P17987 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCP1P17987 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCP1P17987 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCP1P17987 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCP1P17987 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCP1P17987 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCP1P17987 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCP1P17987 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCP1P17987 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCP1P17987 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCP1P17987 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCP1P17987 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCP1P17987 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCP1P17987 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCP1P17987 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCP1P17987 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TCP1P17987 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCP1P17987 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TCP1P17987 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCP1P17987 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TCP1P17987 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCP1P17987 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCP1P17987 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TCP1P17987 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCP1P17987 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TCP1P17987 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCP1P17987 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCP1P17987 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCP1P17987 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCP1P17987 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCP1P17987 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCP1P17987 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCP1P17987 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCP1P17987 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCP1P17987 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCP1P17987 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCP1P17987 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCP1P17987 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCP1P17987 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCP1P17987 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCP1P17987 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TCP1P17987 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCP1P17987 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCP1P17987 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCP1P17987 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCP1P17987 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCP1P17987 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCP1P17987 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCP1P17987 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCP1P17987 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCP1P17987 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCP1P17987 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCP1P17987 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCP1P17987 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TCP1P17987 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCP1P17987 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCP1P17987 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCP1P17987 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms