Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms