Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
HOXD8P13378 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
HOXD8P13378 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD8P13378 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD8P13378 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD8P13378 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD8P13378 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD8P13378 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD8P13378 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD8P13378 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD8P13378 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD8P13378 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD8P13378 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD8P13378 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD8P13378 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD8P13378 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD8P13378 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD8P13378 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD8P13378 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD8P13378 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD8P13378 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD8P13378 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD8P13378 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD8P13378 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD8P13378 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD8P13378 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD8P13378 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD8P13378 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD8P13378 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD8P13378 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD8P13378 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD8P13378 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD8P13378 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD8P13378 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD8P13378 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD8P13378 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD8P13378 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD8P13378 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms