Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODC1P11926 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODC1P11926 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODC1P11926 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODC1P11926 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODC1P11926 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODC1P11926 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODC1P11926 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODC1P11926 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODC1P11926 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODC1P11926 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODC1P11926 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODC1P11926 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODC1P11926 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODC1P11926 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODC1P11926 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODC1P11926 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODC1P11926 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODC1P11926 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODC1P11926 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODC1P11926 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODC1P11926 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODC1P11926 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ODC1P11926 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODC1P11926 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODC1P11926 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODC1P11926 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODC1P11926 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODC1P11926 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODC1P11926 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODC1P11926 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODC1P11926 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODC1P11926 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODC1P11926 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODC1P11926 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODC1P11926 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODC1P11926 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODC1P11926 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODC1P11926 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODC1P11926 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODC1P11926 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODC1P11926 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODC1P11926 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODC1P11926 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ODC1P11926 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODC1P11926 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODC1P11926 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODC1P11926 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODC1P11926 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODC1P11926 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODC1P11926 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODC1P11926 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ODC1P11926 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ODC1P11926 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODC1P11926 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODC1P11926 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODC1P11926 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ODC1P11926 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODC1P11926 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODC1P11926 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODC1P11926 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODC1P11926 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODC1P11926 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODC1P11926 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODC1P11926 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODC1P11926 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ODC1P11926 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODC1P11926 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODC1P11926 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODC1P11926 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODC1P11926 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODC1P11926 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODC1P11926 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODC1P11926 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODC1P11926 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODC1P11926 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODC1P11926 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ODC1P11926 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODC1P11926 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODC1P11926 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODC1P11926 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODC1P11926 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODC1P11926 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODC1P11926 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ODC1P11926 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODC1P11926 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ODC1P11926 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODC1P11926 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODC1P11926 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODC1P11926 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODC1P11926 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODC1P11926 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODC1P11926 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODC1P11926 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODC1P11926 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODC1P11926 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODC1P11926 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODC1P11926 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODC1P11926 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODC1P11926 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms