Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NGFRP08138 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NGFRP08138 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NGFRP08138 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NGFRP08138 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NGFRP08138 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NGFRP08138 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NGFRP08138 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NGFRP08138 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NGFRP08138 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NGFRP08138 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NGFRP08138 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NGFRP08138 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NGFRP08138 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NGFRP08138 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NGFRP08138 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NGFRP08138 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NGFRP08138 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NGFRP08138 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NGFRP08138 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NGFRP08138 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NGFRP08138 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NGFRP08138 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NGFRP08138 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NGFRP08138 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NGFRP08138 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NGFRP08138 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NGFRP08138 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NGFRP08138 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NGFRP08138 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NGFRP08138 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NGFRP08138 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NGFRP08138 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NGFRP08138 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NGFRP08138 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NGFRP08138 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NGFRP08138 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NGFRP08138 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NGFRP08138 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NGFRP08138 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NGFRP08138 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NGFRP08138 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NGFRP08138 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NGFRP08138 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NGFRP08138 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NGFRP08138 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NGFRP08138 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NGFRP08138 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NGFRP08138 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NGFRP08138 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NGFRP08138 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NGFRP08138 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NGFRP08138 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NGFRP08138 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NGFRP08138 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NGFRP08138 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NGFRP08138 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NGFRP08138 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NGFRP08138 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NGFRP08138 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NGFRP08138 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NGFRP08138 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NGFRP08138 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NGFRP08138 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NGFRP08138 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NGFRP08138 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NGFRP08138 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NGFRP08138 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NGFRP08138 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NGFRP08138 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NGFRP08138 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NGFRP08138 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NGFRP08138 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NGFRP08138 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NGFRP08138 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NGFRP08138 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NGFRP08138 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NGFRP08138 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NGFRP08138 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NGFRP08138 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NGFRP08138 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NGFRP08138 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NGFRP08138 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NGFRP08138 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NGFRP08138 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NGFRP08138 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NGFRP08138 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NGFRP08138 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NGFRP08138 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NGFRP08138 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NGFRP08138 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NGFRP08138 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NGFRP08138 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NGFRP08138 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NGFRP08138 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NGFRP08138 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NGFRP08138 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NGFRP08138 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NGFRP08138 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NGFRP08138 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms